点击在新窗口中浏览此图片BACKGROUND: Formins are a conserved family of actin nucleators responsible for the assembly of diverse actin structures such as cytokinetic rings and filopodia. In the fission yeast Schizosaccharomyces pombe, the formin for3p is necessary for the formation of actin cables, which are bundles of short parallel actin filaments that regulate cell polarity. These filaments are largely organized with their barbed ends facing the cell tip, where for3p is thought to function in their assembly. RESULTS: Here, using a functional for3p-3GFP fusion expressed at endogenous levels, we find that for3p localizes to small dots that appear transiently at cell tips and then move away on actin cables at a rate of 0.3 mum/s. These movements were dependent on the continuous assembly of actin in cables, on the ability of for3p to bind actin within its FH2 domain, and on profilin and bud6p, two formin binding proteins that promote formin activity. Bud6p transiently colocalizes with for3p at the cell tip and stays behind at the cell tip when for3p detaches. CONCLUSIONS: These findings suggest a new model for actin cable assembly: a for3p particle is activated and promotes the assembly of a short actin filament at the cell tip for only seconds. For3p and the actin filament may then be released from the cell tip and carried passively into the cell interior by retrograde flow of actin filaments in the cable. These studies reveal a complex and dynamic cycle of formin regulation and actin cable assembly in vivo.

原文

小巧简洁的wiki程序dokuwiki

[ 2006/06/12 09:30 | by molezz ]
点击在新窗口中浏览此图片最近突然对于wiki比较感兴趣,然后留意了一下相关的程序,在SourceForge上看了看,相关程序不少,最著名的自然是mediawiki,不过没有安装成功,后来留意到dokuwiki.

这是个比较小巧的wiki程序,无需数据库支持,有利有弊吧.想当初刚blog时也是text形式的,最后程序升级成mysql的.现在用用dokuwiki也不错,而且似乎还有ajax的影子,感觉很不错.弄了一下现在就差中文搜索问题了,其他基本已经搞定.看到台湾的站点都支持中文单词的搜索,但是google了半天没有找到解决的办法.不过暂时应该影响不大,大不了先用google的搜索功能.

用wiki来整理所学的生物知识不错.小巧,定制性高.而且很重要的一点是支持团队写作,当然这只是我的理想状态,一个人做实验,没有团队确实效率很低的.比较好的应该是一个实验小组,有实验,有讨论,有收获.

Alexa Fluor 488染色法(翻译)

[ 2006/06/06 09:31 | by molezz ]
用下来感觉这个方法比较简便和快速.文献是染烟草,不过glycerol的浓度我用在水稻中也行.

每200ul的actin buffer(100mM PIPES, 10mM EGTA, 5mM MgSO4 and 0·3 M mannitol,pH 6·9)中加4ul的glycerol,5ul的Alexa Fluor 488,混匀,染色35min(即终浓度2%的glycerol,1u的Alexa Fluor 488).

引用
actin buffer (100mM PIPES, 10mM EGTA, 5mM MgSO4 and 0·3 M mannitol,pH 6·9), containing 2% (w/v) glycerol (1,2,3-propane-triol,99% pure, UCB) and 0·198 mM RLP (rhodamine-labelled phalloidin, Molecular Probes, stock dissolved in methanol).To avoid plasmolysis, the glycerol concentration has to be adapted to the cell type used. For staining the tobacco cells it was brought to 1% (w/v). Actin labelling was observed after 35 min and was further evaluated with time.


OLYSLAEGERS, Improved staining of F-actin and co-localization of mitochondria in plant cells. Journal of Microscopy, Vol. 192, Pt 1, October 1998, pp. 73–77., 1998.

又要工作报告了

[ 2006/06/01 07:50 | by molezz ]
点击在新窗口中浏览此图片下周要工作报告了,居然是世界杯那天.

现在工作报告轮的真快,以前一个多月到两个月,现在几乎只有3-4周,有时真是不知道能够讲些什么.看来实验室人变少也有不利的地方.文献和工作报告的周期变短了,每次7个人......一天分早上下午,这点倒是不错,否则整个周六就全没了,而且还要听完全不明白的东西.

最近的实验颇没有头绪,只能规规矩矩的做,完全没有了刚进实验室的感觉,这可能就是进实验室时间长的一种悲哀吧,整天想着这个实验会不会有结果,怎么交待,而不是当初想着怎么通过各种方法来解决问题,再加上周围师兄师姐的影响,士气更加低了,不知道这是不是国内实验室的通病啊?

今天王莹师兄来实验室把他的论文留我一份,并留了毕业赠言,看来真是心情不错啊,毕竟找好工作开始进入社会了,不再是象牙塔里受压迫的一员了.想想李晓星师兄发了那么高的文章还是没有找到工作,老板也没有什么想帮助的意思,看来路是靠自己走出来的.

在中国这样的社会中,说团队精神是没有用的.经济发展的社会,每个人的压力都很大,不论学生还是老板,有时只是为了生存.

let it be

爱尔兰咖啡

[ 2006/05/24 08:42 | by molezz ]
点击在新窗口中浏览此图片「请问要点茶或咖啡?」
「咖啡。」
「请问您要哪种咖啡?」
「爱尔兰咖啡。」
「需要加眼泪吗?」
「啊?什么?」
           ------摘自蔡智恒《爱尔兰咖啡》

以前看《爱尔兰咖啡》,为那里面的咖啡所吸引,想着什么时候能尝一下就好了。去酒吧也许能尝到可能地道的爱尔兰咖啡,但终究只是可能地道的。

前阵子买了一瓶威士忌,于是就突发奇想自己尝试弄一杯试试。网上查了一下具体方法,看来果然像小说中那样,很复杂,而且手头除了咖啡,牛奶和威士忌,我没有其他的材料,而威士忌又是苏格兰的,不是爱尔兰的。算了,只是试着玩玩而已。

于是动手弄起来,将过程最简单化。在四方杯中用水冲了一杯麦斯威尔咖啡(顺序都错了……),然后趁热加入了一些威士忌(没有量器,就估计了),因为方法中说先要烧杯和威士忌的,虽然我有高脚杯,但是可不舍得烧(当时买了20多RMB……,和杨功达一起买的,烧坏就郁闷了)。再加了一些牛奶(代替奶油),尝了一下,基本还是很重的酒味,于是又加了一点奶,还是酒味较重,咖啡的苦最后才尝到(没有加咖啡伴侣)。酒味较重,分析可能是由于苏格兰威士忌的原因吧,小说中提到之所以用爱尔兰威士忌,而不是更加有名的苏格兰威士忌,就是因为苏格兰威士忌的烟熏味太重,影响酒和咖啡之间味道的融合。

总体说来感觉还是不错的,有空再弄一杯,以前喝咖啡都是不加任何东西,非常的苦。现在加了奶和威士忌,不是那么苦了。爱尔兰咖啡的建议饮用时间为午夜12点,不过我想要是那时喝,还能睡觉吗?酒是催眠,而咖啡提神,到底哪个占上风呢?看来之于我还是8,9点喝比较合适啊。

引一段小说中对于爱尔兰咖啡的描述
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